Woodpecker Detective's Office est animé par le studio LIDEN FILMS et a comme réalisateur MAKINO Tomoe. Le poste de réalisateur en chef est occupé par EZAKI Shinpei (Gunslinger Stratos, Monster Strike The Movie ou encore Hanebado!). La structure scénaristique de la série est gérée par KISHIMOTO Taku (Silver Spoon, Erased ou encore 91 Days). Le design original des personnages SAKI Kaoru est adapté par SAKI Kaoru pour le passage à l'animation. La composition musicale est assurée par MONACA (Working!!, Captain Earth ou encore Vanishing Line - Garo).
Nous sommes à la fin de l'ère Meiji, au moment où le Japon s'occidentalise et commence à se moderniser. Un brillant poète, Takuboku Ishikawa, démarre une activité de détective en réaction à une affaire de meurtre. Il l'appelle le bureau du détective Woodpecker.
Il est alors entraîné dans une étrange affaire autour de phénomène apparemment surnaturels par le biais d'une connaissance venue de sa ville natale, Kyôsuke Kindaichi, qui devient son assistant. D'autres auteurs de son époque comme Kodo Nomura, IsamuYoshii, Sakutarô Hagiwara et Bokusui Wakayama participent également aux exploits de cette curieuse agence...