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A Certain Scientific Accelerator est réalisé par KAMANAKA Nobuharu (Big Order) et est animé par le studio J.C. STAFF. La structure scénaristique de la série est gérée par SUGIHARA Kenji (Shiki, Oreca Battle ou encore Clockwork Planet). Le poste de character designer est occupé par YAEGASHI Yōhei (Aki no Kanade). La composition musicale est assurée par IUCHI Maiko (Franchise To Aru, Heavy Object ou encore RErideD).
Après avoir sauvé Last Order et pris une balle dans la tête, Accelerator, le plus puissant des êtres dotés de pouvoirs extrasensoriels de la Cité académique, se repose à l’hôpital. Mais sa guérison est interrompue lorsqu'une mystérieuse fille possédant une photo du clone de Misaka Mikoto lui demande de l’aide. Un groupe de fanatiques anti-pervers qui se fait appeler « Disciplinary Action » est en train de semer la pagaille. Ils s'en prennent directement à Last Order et menacent la Cité académique, voire le monde entier...