À Londres, la mystérieuse Aria est poursuivie par une force déconcertante. Désespérée, elle demande l'aide du légendaire Professeur Layton et de son assistant Luke Triton. Mais, avant même que le célèbre duo comprenne de quoi il s'agit, Aria se fait enlever. Partis à sa recherche, Layton et Luke tombent sur un livre étrange et sont transportés dans la ville médiévale bizarre de Labyrinthia, un endroit que l'on dit empli de magie et habité par des sorcières !
Pendant ce temps, le ténor du barreau Phoenix Wright et son assistante médium Maya Fey sont aussi téléportés à Labyrinthia après avoir trouvé le même livre lors d'un voyage d'affaires à Londres. Quand il réalise qu'Aria va être jugée pour sorcellerie, Phoenix décide de la défendre. Alors que Phoenix découvre les étranges lois locales, le Professeur Layton entreprend de résoudre les mystères de Labyrinthia.
Source : http://www.nintendo.fr/Jeux/Nintendo-3DS/Professeur-Layton-vs-Phoenix-Wright-Ace-Attorney--845517.html