Suikoden I
Le héros de Suikoden, qui peut être nommé par le joueur, est le fils du Grand Général Teo McDohl. Alors que son père est appelé au front des frontières Nord, le joueur débute son aventure durant l’entraînement de la garde à Gregminster. Le cours des événements le chargera de protéger la Rune du Début; l’une des 27 runes gouvernant le monde, ce qui mènera le héros à quitter la capitale. Il rencontrera par la suite une organisation rebelle et s’embarquera pour une mission à la recherche des Etoiles du Destin – des alliés incontournables pour restaurer la paix et sauver leur chez eux.
Suikoden II
Suikoden II est centré sur un orphelin nommé par le joueur, sa sœur Nanami ainsi que son ami Jowy. Ce trio improbable sera plongé au cœur d’une guerre entre le royaume de Highland et la ville-état de Jowston. Ces trois héros se mettront donc en route pour un périple qui remettra en cause leurs perceptions de la vie, de la société et de la guerre tandis qu’ils uniront les célèbres 108 Etoiles du Destin, de manière similaire au premier opus.