Dans le but d'apporter le bonheur au peuple japonais, le projet ARK a été lancé. Ce projet est basé sur l'utilisation à grande échelle de robots d'assistance. Au cours du processus, le docteur Kōmyōji a essayé d'implanter un circuit de conscience mais il se heurta à Gill Herbert qui souhaitait les utiliser pour résoudre des conflits armés.
C'est à cette époque que le docteur Kōmyōji trouva la mort dans un violent accident. Il eut malgré tout le temps de donner les résultats de ses recherches à son fils Masaru qui se trouve maintenant pris pour cible. Heureusement, il peut compter sur la protection de sa soeur Mitsuko et de Jiro, un androïd à apparence humaine créé par Kōmyōji et possédant le circuit de conscience.
Alors que l'androïd de combat Hakaider apparaît, Jiro n'a d'autre choix que de devenir Kikaider.